高雄市東吳大學校友會成立於1963年,是在臺復校後成立時間超越半個世紀的校友會之一。歷任的會長熱心經營校友會事務,每年都有舉辦大型活動聯絡校友們的情誼。近年在林瑞章會長的帶領下年年都參與「校友盃高爾夫球聯誼賽」,同時也熱情接待一年一度的第3哩單車環島及畢業校友單車環島活動。
本會每年舉辦校友大會暨新春聯誼,1992年2月舉行第六屆校友大會,由白美香會長進行重要會務報告,並頒贈「開國八十年紀念幣」予工作人員表達感謝;之後順利選出新任理事15人、監事5人, 由白美香連任會長。當天並安排新春團拜及母校章孝慈校友進行專題演講,以及當場籌得綜合大樓建築基金135萬元,為感謝校友的熱忱贊助,特別將一間教室命名為「高雄室」。
由校友總會指導、東吳大學發展處與台北市校友會主辦的「校友盃高爾夫球聯誼賽」,已成為本會的年度盛事,自2008年每年組隊參加。
2019年8月由總會劉吉人理事長領軍的鮭魚返鄉計畫第三彈來到高雄,由本會與南區高爾夫球隊負責接待即將入學的東吳新生。本次活動邀請南區高爾夫球隊隊長盧良山學長(財精系68級)、陳永春學長(會計系66級)、邱武璋學長(化學系77級)、康立孝(哲學系95級)學長及陳素芬學姐與學弟妹分享經驗、交流。