中華民國東吳大學校友總會於民國87年3月成立，以團結校友力量、支持母校發展、落實校友愛校精神、服務校友為宗旨。迄今已是第七屆，共有理事23人，監事7人，現任理事長為財精系75級陳惠貴學長。

中華民國東吳大學校友總會每年召開理監事會議及會員大會，會議中，由理事長進行會務說明，向全體校友及理監事報告校友總會的運作及發展狀況；同時，校友總會也舉辦各種活動來服務校友，以凝聚校友們對總會及母校的向心力。

1. 東吳大學校友總會每一會員之權利如左：
   
   1. 表決權。
   2. 選舉權、被選舉權及罷免權。
   3. 東吳大學校友總會所舉辦各項公共活動之參與權。
2. 東吳大學校友總會每一會員之權利如左：
   
   1. 遵守東吳大學校友總會章程及決議案。
   2. 擔任東吳大學校友總會所指派之職務。
   3. 繳納會費。
3. 東吳大學校友總會會員有違反法令，章程或不遵守會員大會決議時，得經理事會決議，予以警告或停權處分，其為害團體情結重大者，得經會員大會決議與以除名。
4. 有左列情形之一者，即自然喪失會員資格：
   
   1. 犯罪經刑事判決確定在執行中或在通緝中者。
   2. 褫奪公權尚未復權者。
   3. 經禁治產宣告，尚未撤銷者。
5. 會員有左列情事之者，應退會：
   
   1. 喪失會員資格者。
   2. 經會員大會決議除名者。
6. 會員得以書面敘明理由向東吳大學校友總會聲明退會，並於會計年度結束時生效。
7. 東吳大學校友總會以會員大會為最高權力機構，在會員大會閉會期間，由理事會代其職權，理事會為監察機構。
8. 會員大會之職權如左：
   
   1. 訂定與變更章程。
   2. 選舉及罷免理事、監事。
   3. 議決入會費、常年會費、事業費及會員捐款之數額及方式。
   4. 議決年度工作計畫、報告及預算
   5. 議決會員﹝會員代表﹞之除名處分。
   6. 議決東吳大學校友總會之解散。
   7. 議決與會員權利義務有關之其他重大事項
9. 東吳大學校友總會置理事二十三人、監事七人，均由會員大會以無記名連記名票選之，分別成立理事會、監事會。東吳大學校友總會得設常務理事暨常務監事，由理事、監事互選之。理事、監事得採用通訊選舉，但不得連續辦理。通訊選舉辦法由理事會通過，報請主管機關核備後行之。